Consultório de Pesquisa – Clínica de Estomatologia
Responsável: Profa. Dra. Maria Aparecida Borsatti Luchetti
O Consultório destina-se à pesquisa e atendimento de qualquer área clínica do Depto de Estomatologia, como análise de métodos de diagnóstico, terapias clínicas e medicamentosas. É uma base estrutural de apoio clínico aos professores e pesquisadores. Apresenta equipamentos que possibilitam monitoramento de parâmetros cardiovasculares ao paciente durante os procedimentos clínicos. As pesquisas realizadas nesse ambiente utilizam as novas técnicas e tecnologias para avaliação e aplicação de procedimentos clínicos e terapias farmacológicas, que poderão repercutir em alterações de protocolos clínicos e incentivar questionamentos para futuras pesquisas. O espaço clínico destina-se a pesquisa clínica, seja para aprimorar técnicas, metodologias, equipamentos ou fármacos. Participam alunos de Iniciação Científica, Mestrado, Doutorado, Pós-Doutorado, professores e pesquisadores na área.
Os equipamentos específicos para monitoramento cardiovascular disponíveis para as pesquisas originam-se de auxílio pesquisa. Já o analgesímetro foi obtido em auxílio pesquisa por docente deste departamento junto a professor do ICB e está atualmente alocado no Laboratório desse professor, pois se destina à pesquisa em animais, para pesquisa em dor. O consultório foi renovado por um modelo Clesla da Belmont – Suíço, doado à FOUSP. Apresenta também equipamento para tomada radiográfica, fotopolomerizador, ultrassom e para esterilização. É ambiente multiusuário, onde cada clínico leva seu material de consumo, clínico/EPI/ alta e baixa rotação.
Laboratório de Análise de Biomoléculas – LBM
Responsável: Profa. Dra. Marília Trierveiler Martins
Neste laboratório são realizadas pesquisas nas quais diferentes técnicas de análise por eletroforese são utilizadas. As análises envolvem de proteínas a produtos de PCR, cuja manipulação deve ser isolada das áreas em que os métodos pré-PCR são realizados, evitando contaminações. Neste laboratório, diversos métodos de eletroforese vertical e horizontal são utilizados. Há também, em área isolada do laboratório, uma sala escura para revelação por quimioluminescência. Este laboratório é um ambiente multiusuário e está aberto para todos os pesquisadores interessados.
Laboratório de Biologia de Células Tronco em Odontologia – LABITRON
Responsável: Profa. Dra. Marília Trierveiler Martins
No LABITRON são desenvolvidas pesquisas sobre os diferentes aspectos das células-tronco e das células-tronco tumorais. Essas pesquisas abordam tanto o processo de regeneração quanto a engenharia de tecidos, a carcinogênese e a resposta das neoplasias a drogas. Outras pesquisas envolvendo biologia celular são também desenvolvidas nesse laboratório, que conta com toda a estrutura para realização de cultivo celular, técnicas diversas de biologia celular, imunocitoquímica, imunofluorescência e biologia molecular.
O LABITRON recebe não apenas pesquisadores vinculados à disciplina de Patologia Oral e Maxilofacial, mas todos aqueles com interesse nas técnicas que podem ser desenvolvidas neste laboratório e que passem por uma capacitação técnica.
Laboratório de Imagem em 3D – Labi-3D
Responsável: Prof. Dr. Marcelo de Gusmão Paraíso Cavacanti
O Laboratório de Imagem em 3D (LABI-3D) da FOUSP teve início de suas atividades em março de 2001. Neste laboratório, são realizados diversos projetos de pesquisa em tomografia computadorizada envolvendo o complexo dentomaxilofacial. O Laboratório conta com programas de imagens volumétricas, como Imaging Studio, Horus e OsiriX, como também workstations com grande capacidade para o pós-processamento destas imagens como computadores iMac 27. Estes programas associados aos hardwares permitem simultaneamente a reconstrução volumétrica a partir de tomografia computadorizada (TC), criação de volume e visualização das reconstruções multiplanares e em 3D utilizando imagens DICOM, provenientes de diversos tomógrafos.
As linhas de pesquisa consistem em estudos da tomografia computadorizada por feixe cônico e helicoidal nas áreas de: Traumatologia e Cirurgia bucomaxilofacial, ATM, Patologia, Implantodontia, Anomalias craniofaciais, Odontologia Forense, Endodontia e Periodontia. Diversos protocolos de pós-processamento de imagens são desenvolvidos no LABI-3D. Participam destes projetos, aluno de iniciação científica, mestrado, doutorado, pós-doutorados, professores da FOUSP e de instituições externas à USP. Até o momento, já foram finalizados mais de 40 projetos relacionados a estas diversas especialidades. Até dezembro de 2022, foram publicados mais de 100 trabalhos completos em periódicos indexados no PuBMed e mais de 1.400 citações pelo SCOPUS. O LABI-3D é referência nacional e internacional no estudo da tomografia computadorizada no ensino, pesquisa e extensão da Odontologia.
Laboratório de Imuno-Histoquímica – LIM
Responsável: Profa. Dra. Marília Trierveiler Martins
Este laboratório dispõe de toda a infraestrutura necessária para realização das técnicas de imuno-histoquímica e hibridização in situ, que são utilizadas tanto em diagnóstico, como auxiliar do exame anatomopatológico, quanto em grande número de pesquisas realizadas por docentes e discentes, não apenas do Departamento como de outras áreas e instituições.
Destaca-se a grande biblioteca de anticorpos para detecção de antígenos humanos e de animais experimentais.
Laboratório de Microscopia e Sistemas Digitais – LMS
Responsável: Profa. Dra. Luciana Correa
O Laboratório de Microscopia e Sistemas Digitais é equipado com sistema wi-fi e computadores em rede, sistema integrado de transmissão de imagens digitais e analógicas, mesa para transmissão de imagens analógicas, microscópios binoculares de luz convencional e sistema de microscopia digital. O espaço contém bancadas de trabalho e televisores destinados às atividades da graduação, pós-graduação e outras que envolvam transmissão de imagens e uso de dispositivos móveis e trabalhos em equipe.
Laboratório de Patologia Cirúrgica – LPC
Responsável: Profa. Dra. Marilia Trierveiler Martins
O Laboratório de Patologia Cirúrgica é o responsável pelo processamento dos casos recebidos para diagnóstico no Serviço de Patologia Cirúrgica, que atende cerca de 100 casos por semana. O laboratório conta com toda a infraestrutura para processamento histológico e citológico, com automação de todas as etapas que podem ser feitas dessa forma. São realizadas todas as técnicas de histologia convencionais e técnicas especiais de coloração. Além do suporte ao referido serviço, que recebe amostras de qualquer profissional que deseje atendimento de seus pacientes, nesse laboratório são realizadas inúmeras pesquisas, tanto do departamento quanto de outras áreas e instituições.
Está equipado com aparelho auto técnico para processamento do material, uma máquina de inclusão em parafina (Tissue Tek Sakura) e corador de lâminas automático (Tissue Tek Sakura) com capacidade de processamento de 80 lâminas em 1 hora, 1 destilador de osmose reversa (Gehaka) 1 unidade de ultra purificação de água Milli-Q Synergy (Millipore). Além disso, contamos com 1 micrótomo (Slee), um aparelho de montagem de lâminas com fita de polietileno (Tissue Tek Sakura), e todos os equipamentos de suporte necessários. Essa infraestrutura permite rapidez e alta qualidade no processamento do material.
Nosso acervo de lâminas conta hoje com cerca de 108.500 biópsias de lesões bucais e cerca de 13.000 lâminas de citolologia Todos os dados de nosso arquivo de lâminas e blocos são informatizados, bem como o serviço de emissão de laudos patológicos. Além de garantir a integridade dos dados, o arquivo digital permite a recuperação e tabulação de informações de forma rápida e eficaz.
Laboratório de Patologia Experimental – LPE
Responsável: Profa. Dra. Luciana Correa
O Laboratório de Patologia Experimental realiza testes bioquímicos manuais para sorologia e outros fluidos biológicos, cortes e colorações histológicas, imuno-histoquímica e imunofluorescência, testes imunoenzimáticos, análise de dano no DNA por teste cometa, morfometria microscópica e quantificação de proteínas por Western blot.
Possui também infraestrutura para o desenvolvimento de metodologias envolvendo membrana corioalantóica com ovos de galinha.
Laboratório de Patologia Molecular – LPM
Responsável: Prof. Dr. Fábio Daumas Nunes
Possui grande infraestrutura em equipamentos destinados principalmente para a realização de técnicas de Western blotting, PCR e hibridização in situ, e equipamentos auxiliares para essas e outras metodologias. É utilizado tanto para pesquisa quanto para diagnóstico. Podem ser processados tecidos parafinados ou congelados, originários dos tecidos moles ou duros. O espaço é utilizado por diversas disciplinas da FOUSP, outras unidades da USP, e também de outras instituições do país.
Embora o espaço esteja disponível para qualquer pesquisador, é necessária uma solicitação formal para acesso às dependências, não só pelo alto uso dos equipamentos, mas também devido a aspectos relacionados com biossegurança. O laboratório possui uma página na internet onde informações importantes estão disponíveis.
Carcinogênese
Muitas alterações genéticas têm sido relacionadas com o surgimento e a progressão do carcinoma epidermóide de boca, e os estágios dessa carcinogênese tem sido mais bem definidos. A expressão de genes envolvidos no reparo do DNA e na estabilidade do genoma está freqüentemente comprometida.
As alterações genéticas comumente observadas nos cânceres de boca incluem a perda de heterozigose em regiões suspeitas de possuírem ou onde estão genes supressores de tumor, particularmente 3p (FHIT), 9p (CDKN2A) and 17p (TP53). Muitos autores confirmam que o gene TP53 gene está mutado na maioria dos carcinomas de boca, e que outros genes na sua via de sinalização estão com freqüência comprometidos, inclusive a deleção do CDKN2A.
A amplificação e superexpressão de oncogenes são também observadas, por exemplo o lócus CCND1 em 11q13 e PIK3CA em 3q26. Mutações nos genes Ras são também descritas, embora exista considerável variação entre diferentes populações. Este fato pode ser devido à exposição a diferentes agentes carcinogênicos, por exemplo mutações no H-Ras são observadas mais freqüentemente em pacientes da Índia que costumam mascar tabaco. A ativação da telomerase, que promove a sobrevivência de células que carregam anomalias genéticas, também tem sido observada. A superexpressão da ciclooxigenase-2 (COX2) e do receptor do fator de crescimento epitelial fosforilado (pEGFR) também é importante na carcinogênese e pode fornecer alvos moleculares para o tratamento dessa neoplasia.
O polimorfismo em genes envolvidos com o metabolismo de carcinógenos contidos no tabaco e álcool, também têm sido relacionados com a suscetibilidade individual. As enzimas glutiona S-transferase (GSTM1 e GSTT1) estão expressas nos tecidos da boca e atuam na desintoxicação de certos carcinógenos do tabaco. Alguns estudos têm sugerido que pessoas com genótipo nulo para o GSTM1 ou GSTT1 têm um risco discretamente maior para o câncer de boca. Outras enzimas que metabolizam carcinógenos também têm sido relacionadas com a suscetibilidade ao câncer de boca, como o citocromo p450, as N-acetiltransferases e a álcool dehidrogenase, mas sua ação não está claramente determinada.
Um risco aumentado de câncer de boca também esta associado com síndromes de câncer hereditário, como Li-Fraumeni, anemia de Fanconi e xeroderma pigmentoso. Alguns estudos têm sugerido que existe um componente hereditário no câncer de boca esporádico, por exemplo parentes em primeiro grau de pacientes com câncer de boca parecem ter um risco maior de desenvolver a doença. Existem dificuldades no separar os efeitos genéticos do ambiente comum em estudos com família, mas as evidências estão se acumulando de que existe um componente hereditário no câncer de boca, possivelmente associado a uma maior suscetibilidade a danos genéticos provocados por mutagênicos ambientais. Aqueles com uma suscetibilidade hereditária estariam mais propensos a desenvolver mais neoplasias primárias.
Informações para o Público
Informações gerais
O carcinoma epidermóide (ou carcinoma espinocelular, ou carcinoma de células escamosas) representa a neoplasia maligna mais freqüente da boca, responsável por aproximadamente 95% do total de casos. Os outros 5% estão representados por linfomas, melanomas, sarcomas e por neoplasias malignas oriundas das glândulas salivares e do tecido odontogênico.
O perfil do paciente que desenvolve um carcinoma epidermóide de boca está representado principalmente por homens mais velhos, acima dos 50 anos de idade e que fez uso dos fatores predisponentes mais conhecidos, que são o hábito de fumar e ingerir bebidas alcoólicas. As mulheres também podem apresentar esse tipo de câncer, associados também a esses fatores. O câncer de boca já foi relatado em pacientes mais jovens abaixo dos 40 anos de idade.
Locais mais comuns
Os locais da boca mais freqüentemente atingidos são: a língua, o lábio inferior e o assoalho da boca, embora a lesão possa ocorrer em qualquer outro local. As metástases (mesmo tumor espalhado para outros locais), quando acontecem, envolvem principalmente os gânglios do pescoço, pulmão, ossos e fígado.
Apresentação clínica
O carcinoma epidermóide de boca se apresenta à observação de forma diversificada, variando de lesões ulceradas e profundas a lesões que se projetam acima da superfície da boca. Outras lesões menos sugestivas podem ocorrer sob a forma de placas brancas ou áreas avermelhadas, ou mesmo uma mistura de ambas, o que torna a diferenciação dessas lesões de extrema importância para o diagnóstico correto.
Diagnóstico
O diagnóstico deve ser feito por profissional competente, que pode ser um dentista estomatologista ou patologista, ou por um médico otorrinolaringologista ou cirurgião de cabeça e pescoço.
O recurso diagnóstico mais utilizado é a biópsia e o encaminhamento para exame histopatológico que deve ser encaminhado para um patologista com experiência em neoplasias malignas de boca. Atualmente técnicas auxiliares de diagnóstico têm sido utilizadas, como estudos moleculares e imunoistoquímicos, com a finalidade de aprimorar o diagnóstico. O uso desses exames para prever o comportamento do câncer e a resposta à terapêutica ainda não pode ser realizado com segurança.
Fatores causadores
No tabaco e na fumaça que dele se desprende podem ser identificadas cerca de 4700 substâncias tóxicas e dentre essas 60 apresentam ações carcinogênicas conhecidas por causarem mutações importantes na molécula de DNA. Sabe-se que o tabaco é o principal carcinógeno relacionado com o câncer de boca e que sua ação é potencializada pela ingestão de álcool.
O câncer de lábio possui uma causa peculiar, ou seja, está associado com a exposição aos raios solares (ultra-violeta B, UVB), ocorrendo, sobretudo, no lábio inferior devido à localização mais acessível. Outros fatores menos evidentes como deficiências nutricionais e infecções por vírus, dentre outros, têm sido associados com o câncer de boca, porém, são ainda discutidos pelos estudiosos.
Como o câncer aparece é um dos problemas mais complexos, pois muitos dos aspectos pelos quais uma célula normal é se transforma em uma célula maligna permanecem desconhecidos. Há consenso de que o câncer representa uma doença obrigatoriamente genética, causada por alterações na molécula de DNA, desencadeadas por agentes agressores em um indivíduo geneticamente susceptível. De maneira geral, há uma tendência da maioria dos cânceres afetarem pessoas de mais idade, já que o processo se desenvolve em múltiplas etapas, apesar da constatação de casos cada vez mais precoces atualmente.
Vários estudos já identificaram anormalidades genéticas presentes em cânceres de boca e de cabeça e pescoço de maneira geral, porém a importância dessa descoberta ainda não está clara.
Fatores que favorecem um melhor curso do câncer de boca
O conhecimento dos fatores chamados prognósticos do câncer de boca é fundamental não apenas para o planejamento do tratamento adequado, mas também para oferecer ao paciente e seus familiares uma avaliação da situação e das perspectivas para controle da doença. Fatores como idade do paciente quando do surgimento da lesão, localização, estadiamento TNM, resto de células malignas nos tecidos próximos à área da cirurgia, se a lesão é a primeira, se existem metástases, tempo livre de doença após a cirurgia, entre outros, são importantes parâmetros para essa avaliação. O sistema TNM serve para descrever a extensão da doença com base em três componentes: T – tamanho do tumor primário, N – ausência ou presença e a extensão de metástases nos gânglios, M – ausência ou presença de metástases à distância. A esses componentes são adicionados números de acordo com a gravidade do câncer, e esses aspectos assim reunidos servem para determinar o estágio clínico da doença de maneira que, quanto maior a classificação do estágio, pior o prognóstico para o paciente. Em geral pode-se dizer que quanto maior a lesão, quanto mais tempo demorar o diagnóstico ou a cirurgia, pior para o paciente.
Links úteis
Animais
Biotério de Produção e Experimentação – Faculdade de Ciências Farmacêuticas e Instituto de Química – Manual de Cuidados e Procedimentos com Animais de Laboratório
Publicação
eTBlast (Blast Medline!!) – is a unique search engine for searching biomedical literature. Searches an entire paragraph and returns MEDLINE abstracts that are similar to it.
Google Acadêmico – fornece uma maneira simples de pesquisar literatura acadêmica de forma abrangente. Você pode pesquisar várias disciplinas e fontes em um só lugar: artigos revisados por especialistas (peer-rewiewed), teses, livros, resumos e artigos de editoras acadêmicas, organizações profissionais, bibliotecas de pré-publicações, universidades e outras entidades acadêmicas. O Google Acadêmico ajuda a identificar as pesquisas mais relevantes do mundo acadêmico.
International Committee of Medical Journal Editors (ICMJE) – Uniform Requirements for Manuscripts Submitted to Biomedical Journals: ethical considerations, publishing and editorial issues, manuscript preparation, and references.
Jane – Pesquisa de revistas para publicar, que revista submeter, artigos relevantes para citar ou para encontrar revisores para um artigo.
Plagium – é um serviço, atualmente em teste beta, Septet Systems Inc.. Septet Systems Inc. centra-se no desenvolvimento de informações de pesquisa inovadora para os consumidores, empresas, governos, acadêmicos e de saúde. O trabalho é baseado no motor TX Miner propriedade Septet Systems, que usa técnicas avançadas de busca para aprofundar a exploração de documentos na Web, ou em bancos de dados privados.
PUBLICASE – A Publicase é a primeira empresa de comunicação científica do país dedicada exclusivamente à comunicação científica e ao avanço na publicação internacional de mais e melhores artigos na área biomédica.
Visuwords™ online graphical dictionary — Look up words to find their meanings and associations with other words and concepts. Produce diagrams reminiscent of a neural net. Learn how words associate.
Instituições
Procura em banco de dados
Enzimas de restrição Database (REBASE) – is a collection of information about restriction enzymes and related proteins.
Fasta Search Form Pesquisa Blast (NCBI) – finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance of matches.
GDB Human Genome Database – Banco de dados oficial para anotação do genoma humano.
Human Genome Variation Society – lista de banco de dados relacionados com mutação.
Human Genome Organization (HUGO) – é uma organização internacional de cientistas envolvidos com genética humana. O site tem links interessantes para assuntos como ética, nomenclatura e propriedade intelectual.
MGC – The Mammalian Gene Collection – The goal of the Mammalian Gene Collection (MGC) is to provide full-length open reading frame (FL-ORF) clones for human, mouse, and rat genes.
NCBI PubMed – service of the National Library of Medicine that includes citations from MEDLINE and other life science journals for biomedical articles back to the 1950s.
NCBI Entrez Nucleotídeos – collection of sequences from several sources, including GenBank, RefSeq, and PDB.
NCBI Genoma Humano – integrated, one-stop, genomic information infrastructure for biomedical researchers.
Procura PROSITE (ExPASy) – allows to scan protein sequence(s) for the occurrence of patterns, profiles and rules (motifs) stored in the PROSITE database, or to search protein database(s) for hits by specific motif(s).
SNPs – Single nucleotide Polymorphism Database – identification and cataloging of SNPs.
TIGR Mouse Gene Index – integrates research data from international mouse gene research projects.
The Protein Data Bank – single worldwide repository for the processing and distribution of 3-D biological macromolecular structure data.
VectorDB – Banco de Dados de Vetores – contains annotations and sequence information for many vectors commonly used in molecular biology.
VISTA – the single worldwide repository for the processing and distribution of 3-D biological macromolecular structure data.
Análise
BioMath Calculators siRNA Target Finder (GenScript) siRNA Construct Builder (GenScript)
ClustalW Multiple Sequence Alignment – is a general purpose multiple sequence alignment program for DNA or proteins.It produces biologically meaningful multiple sequence alignments of divergent sequences.
CpG island searcher – screens for CpG islands which meet the criteria selected below in submitted DNA sequences (runs only on Internet Explorer).
Gene Discovery Page – It organizes select web-accessible bioinformatics tools in a way that may lead to gene discovery and can be used without any knowledge of Bioinformatics.
Database of Codon Usage – The frequency of codon use in each organism is made searchable through this World Wide Web site.
Genefisher: Interactive Primer Design Primer design at Center for Genome Research Oligo Calculator Restriction Enzyme Analysis Web Cutter NEBcutter (New England Biolabs) – This tool will take a DNA sequence and find the large, non-overlapping open reading frames using the E.coli genetic code and the sites for all Type II restriction enzymes that cut the sequence just once.
PPP – perform promoter prediction on FASTA formatted DNA sequences.
RF Finder – is a graphical analysis tool which finds all open reading frames of a selectable minimum size in a user’s sequence or in a sequence already in the database.
Splice Site Prediction Promoter Scan – Predicts Promoter regions based on scoring homologies with putative eukaryotic Pol II promoter sequences.
Signal sequences scan – Find and list homologies of published signal sequences with the input DNA sequence.
WWWtacg (restriction analysis) – This form allows you to supply both DNA sequence and (optionally) your own file of Restriction Enzymes or other IUPAC patterns in GCG format for Restriction Enzyme Mapping and Analysis.
WatCut (restriction analysis) – An on-line tool for restriction analysis, silent mutation scanning, and SNP-RFLP analysis.
Protocolos
Extração e Purificação – Vários protocolos de extração de DNA, de células, blocos de parafina, microorganismos, sangue, entre outros, bem como de purificação do DNA obtido.
Homeobox
The homeobox page – On this page Thomas R. Bürglin try to maintain information relevant to homeobox genes (in particular about classification/evolution).
HOX database – Página com muita informação sobre essa família de genes.
Microscópio de Microdissecção a Laser
O microscópio de microdissecção a laser (LCM) ArcturusXT™ foi adquirido da empresa Life Technologies com verba FAPESP. O microscópio que adquirimos permite isolar populações celulares específicas, ou apenas uma célula, de cortes de tecido congelado ou parafinado e, em nosso caso, extrair ácido nucléicos dessas células. Dessa forma, pode-se analisar a expressão diferentes entre populações de células diferentes em um mesmo tecido. O microscópio poderá ser utilizado por todos aqueles que o desejarem, desde que assistam uma demonstração com o técnico do laboratório, estudem o material disponibilizado, e aceitem um acompanhamento inicial até que sejam considerados habilitados para o uso do equipamento. Esse procedimento é necessário para evitar o mal uso do equipamento. Após esse treinamento inicial poderá ser feito agendamento eletrônico para uso do equipamento em agenda específica disponível online.
Clique aqui para solicitar agendamento
Material para leitura
- Reproducibility, fidelity, and discriminant validity of mRNA amplification for microarray analysis from primary hematopoietic cells. Li L, Roden J, Shapiro BE, Wold BJ, Bhatia S, Forman SJ, Bhatia R. J Mol Diagn. 2005 Feb;7(1):48-56. PMID: 15681474
- Options available for profiling small samples: a review of sample amplification technology when combined with microarray profiling. Nygaard V, Hovig E. Nucleic Acids Res. 2006 Feb 9;34(3):996-1014. PMID: 16473852
- Laser-capture microdissection. Espina V, Wulfkuhle JD, Calvert VS, VanMeter A, Zhou W, Coukos G, Geho DH, Petricoin III EF, Liotta LA. Nature Protocols. 2006; 1(2):586-603.
- Laser capture microdissection: Big data from small samples. Datta S, Malhotra L, Dickerson R, Chaffee S, Sen CK, Roy S. Histol Histopathol. 2015 Nov;30(11):1255-69. Review. Link: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4665617/
Orientações para uso do Equipamento
Publicações
Publicações selecionadas (relacionadas com cancer de cavidade oral)
- PROX1 gene is differentially expressed in oral cancer and reduces cellular proliferation. Rodrigues MF, de Oliveira Rodini C, de Aquino Xavier FC, Paiva KB, Severino P, Moyses RA, López RM, DeCicco R, Rocha LA, Carvalho MB, Tajara EH, Nunes FD. Medicine (Baltimore). 2014 Dec;93(28):e192. doi: 10.1097/MD.0000000000000192.
- Epigenetic repression of HOXB cluster in oral cancer cell lines. Xavier FC, Destro MF, Duarte CM, Nunes FD. Arch Oral Biol. 2014 Aug;59(8):783-9. doi: 10.1016/j.archoralbio.2014.05.001.
- MicroRNA expression profile in head and neck cancer: HOX-cluster embedded microRNA-196a and microRNA-10b dysregulation implicated in cell proliferation. Severino P, Brüggemann H, Andreghetto FM, Camps C, Klingbeil Mde F, de Pereira WO, Soares RM, Moyses R, Wünsch-Filho V, Mathor MB, Nunes FD, Ragoussis J, Tajara EH. BMC Cancer. 2013 Nov 9;13:533. doi: 10.1186/1471-2407-13-533.
- High-throughput sequencing of small RNA transcriptomes reveals critical biological features targeted by microRNAs in cell models used for squamous cell cancer research. Severino P, Oliveira LS, Torres N, Andreghetto FM, Klingbeil Mde F, Moyses R, Wünsch-Filho V, Nunes FD, Mathor MB, Paschoal AR, Durham AM. BMC Genomics. 2013 Oct 26;14:735. doi: 10.1186/1471-2164-14-735.
- TGIF1 splicing variant 8 is overexpressed in oral squamous cell carcinoma and is related to pathologic and clinical behavior. Libório TN, Ferreira EN, Aquino Xavier FC, Carraro DM, Kowalski LP, Soares FA, Nunes FD. Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol. 2013 Nov;116(5):614-25. doi: 10.1016/j.oooo.2013.07.014.
- Proteomic approaches identify members of cofilin pathway involved in oral tumorigenesis. Polachini GM, Sobral LM, Mercante AM, Paes-Leme AF, Xavier FC, Henrique T, Guimarães DM, Vidotto A, Fukuyama EE, Góis-Filho JF, Cury PM, Curioni OA, Michaluart P Jr, Silva AM, Wünsch-Filho V, Nunes FD, Leopoldino AM, Tajara EH. PLoS One. 2012;7(12):e50517.
- Prognostic significance of NDRG1 expression in oral and oropharyngeal squamous cell carcinoma. Dos Santos M, da Cunha Mercante AM, Nunes FD, Leopoldino AM, de Carvalho MB, Gazito D, López RV, Chiappini PB, de Carvalho Neto PB, Fukuyama EE; Head Neck Genome Project/GENCAPO, Tajara EH, Louro ID, da Silva AM. Mol Biol Rep. 2012 Dec;39(12):10157-65.
- Homeobox gene expression profile indicates HOXA5 as a candidate prognostic marker in oral squamous cell carcinoma. Rodini CO, Xavier FC, Paiva KB, De Souza Setúbal Destro MF, Moyses RA, Michaluarte P, Carvalho MB, Fukuyama EE; Head And Neck Genome Project Gencapo, Tajara EH, Okamoto OK, Nunes FD. Int J Oncol. 2012 Apr;40(4):1180-8.
- Clinicopathologic and immunohistochemical features of oral neurofibroma. Campos MS, Fontes A, Marocchio LS, Nunes FD, de Sousa SC. Acta Odontol Scand. 2012 Dec;70(6):577-82. doi: 10.3109/00016357.2011.640286. Epub 2012 Jan 3.
- ORAOV1 is amplified in oral squamous cell carcinoma. Xavier FC, Rodini CO, Paiva KB, Destro MF, Severino P, Moyses RA; Head and Neck Genome Project GENCAPO, Tajara EH, Nunes FD. J Oral Pathol Med. 2012 Jan;41(1):54-60.
- Immunohistochemical expression of p53, p16 and hTERT in oral squamous cell carcinoma and potentially malignant disorders. Abrahao AC, Bonelli BV, Nunes FD, Dias EP, Cabral MG. Braz Oral Res. 2011 Jan-Feb;25(1):34-41.
- In situ hybridization detection of homeobox genes reveals distinct expression patterns in oral squamous cell carcinomas. Libório TN, Acquafreda T, Matizonkas-Antonio LF, Silva-Valenzuela MG, Ferraz AR, Nunes FD. Histopathology. 2011 Jan;58(2):225-33.
- Detection of TGIF1 homeobox gene in oral squamous cell carcinoma according to histologic grading. Matizonkas-Antonio LF, Libório TN, Aquino Xavier FC, Silva-Valenzuela Md, Michaluarte-Júnior P, Nunes FD. Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol Endod. 2011 Feb;111(2):218-24.
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- Genomics and proteomics approaches to the study of cancer-stroma interactions. Rodrigues-Lisoni FC, Peitl P Jr, Vidotto A, Polachini GM, Maniglia JV, Carmona-Raphe J, Cunha BR, Henrique T, Souza CF, Teixeira RA, Fukuyama EE, Michaluart P Jr, de Carvalho MB, Oliani SM; Head and Neck Genome Project GENCAPO, Tajara EH, Cury PM, de Carvalho MB, Dias-Neto E, Figueiredo DL, Fukuyama EE, Góis-Filho JF, Leopoldino AM, Mamede RC, Michaluart-Junior P, Moyses RA, Nóbrega FG, Nóbrega MP, Nunes FD, Ojopi EF, Serafini LN, Severino P, Silva AM, Silva WA Jr, Silveira NJ, Souza SC, Tajara EH, Wünsch-Filho V, Amar A, Bandeira CM, Braconi MA, Brandão LG, Brandão RM, Canto AL, Cerione M, Cicco R, Chagas MJ, Chedid H, Costa A, Cunha BR, Curioni OA, Fortes CS, Franzi SA, Frizzera AP, Gazito D, Guimarães PE, Kaneto CM, López RV, Macarenco R, Magalhães MR, Meneses C, Mercante AM, Pinheiro DG, Polachini GM, Rapoport A, Rodini CO, Rodrigues-Lisoni FC, Rodrigues RV, Rossi L, Santos AR, Santos M, Settani F, Silva FA, Silva IT, Souza TB, Stabenow E, Takamori JT, Valentim PJ, Vidotto A, Xavier FC, Yamagushi F, Cominato ML, Correa PM, Mendes GS, Paiva R, Ramos O, Silva C, Silva MJ, Tarlá MV. BMC Med Genomics. 2010 May 4;3:14. doi: 10.1186/1755-8794-3-14.
- Epigenetic silencing of CRABP2 and MX1 in head and neck tumors. Calmon MF, Rodrigues RV, Kaneto CM, Moura RP, Silva SD, Mota LD, Pinheiro DG, Torres C, de Carvalho AF, Cury PM, Nunes FD, Nishimoto IN, Soares FA, da Silva AM, Kowalski LP, Brentani H, Zanelli CF, Silva WA Jr, Rahal P, Tajara EH, Carraro DM, Camargo AA, Valentini SR. Neoplasia. 2009 Dec;11(12):1329-39.
- WNT-5A, but not matrix metalloproteinase 3 or beta-catenin protein, expression is related to early stages of lip carcinogenesis. Xavier FC, Rodini CO, Ramalho LM, Mantesso A, Nunes FD. J Oral Pathol Med. 2009 Oct;38(9):708-15. doi: 10.1111/j.1600-0714.2009.00756.x. Epub 2009 Mar 11.
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Informações :
Prof. Dr. Fabio Daumas Nunes
Laboratório de Patologia Molecular
Faculdade de Odontologia da USP
Avenida Professor Lineu Prestes, 2227
Cidade Universitária – São Paulo/SP
CEP: 05508-000
Tel: (+55 11) 3091-7902 ou 3091-7894
Laboratório de Pesquisa do ODE
Responsáveis: Profa. Dra. Camila de Barros Gallo, Profa. Dra. Carina Domaneschi, Profa. Dra. Marinella Holzhausen Caldeira
O Laboratório Multidisciplinar da Estomatologia realiza processamento histológico de material não descalcificado, processamento de amostras salivares e de fluido gengival e cultura micológica. Também passou a ser utilizado como laboratório de impressão 3D, em que se faz a impressão e processamento de corpos de prova, coroas, guias cirúrgicas, placas oclusais e modelos de estudo, utilizados na linha de pesquisa de Odontologia Digital, sendo o responsável o Prof. Dr.Marcelo Munhoes Romano.
Laboratório de Radiografia Digital – LADI
Responsável: Prof. Dr. Cláudio Costa
O Laboratório de Radiografia Digital é destinado à pesquisa aplicando sistemas de radiografia digital, avaliando-se a acurácia, a eficiência e o grau de dificuldade em se trabalhar com os diferentes softwares. As pesquisas utilizam as novas tecnologias para avaliação de aplicações e limitações de diferentes sistemas de Radiografias Digitais, repercutindo junto aos fabricantes e fornecedores dos equipamentos, estimulando-os a corrigir as falhas e a ampliar o leque de opções, bem como incentivar a formulação de questões que instiguem a pesquisa inovadora sobre os sistemas de radiografias digitais disponíveis. Tem como objetivo informar, refletir e discutir sobre os diferentes métodos e técnicas adotadas.
Mais recentemente iniciaram-se estudos na área de Odontologia Digital (escaneamentos intraorais e impressões 3D). Participam alunos de iniciação científica, mestrado, doutorado, pós-doutorado, professores e pesquisadores na área. Os equipamentos disponíveis para as pesquisas originam-se de acordo efetuado com os diferentes representantes comerciais que os disponibilizam pelo período necessário à conclusão da pesquisa. Possui parceria internacional com a Universidade de Malta.
Laboratório para Análise e Processamento de Imagens – LAPI
Responsável: Prof. Dr. Cláudio Costa
O Laboratório para Análise e Processamento de Imagens da Disciplina de Radiologia do Departamento de Estomatologia da FOUSP, criado em 2003, tem como objetivo desenvolver estudos relacionados às densidades das estruturas anatômicas dentomaxilares e a outras áreas de interesse da Odontologia, utilizando diferentes métodos de diagnóstico.
Os métodos de diagnóstico utilizados são: densitometria óssea (padrão-ouro), radiografias digitais e digitalizadas, tomografias computadorizadas fan-beam e tomografias computadorizadas cone-beam. O desenvolvimento de novos softwares para manipulação e mensuração das densidades, tornaram possíveis comparações entre os resultados encontrados nos diferentes métodos de diagnóstico e suas repercussões no planejamento cirúrgico em Implantodontia, Ortodontia e Periodontia, além de estudos relacionados aos biomateriais. A partir de 2015 foi efetivado o acordo de cooperação internacional com o Departamento de Radiologia Oral da Aarhus Universitet (Dinamarca) e intensificadas as atividades de parceria com a Universidade de Okayama (Japão).
NAP saliva
Responsável: Profa. Dra. Silvia Vanessa Lourenço
O Laboratório NAP SALIVA realiza testes bioquímicos manuais para sorologia e outros fluidos biológicos, cortes e colorações histológicas, imuno-histoquímica e imunofluorescência, morfometria microscópica e quantificação de proteínas.
Sala de Fotomicrografia
Responsável: Prof. Dr. Fabio Daumas Nunes
Neste laboratório são realizadas capturas de imagens em campo claro e escuro, além de polarização. As imagens são para fins didáticos ou de pesquisa, e está aberto como Multiusuários mediante agendamento e autorização.